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將log odds ratio 轉換成effect size

在之前的文章提到過什麼是effect size, 另外一篇文章提到計算effect size的方法,裡面有個計算effect size的計算器,輸入資料之後,就能計算effect size (效應值),非常好用。
研究就是解決一連串的問題,如果你是比較平均值的差異,藉此來算effect size,這是由計算器就可以得到的。
然而,如果你的結果是odds-ratio或是risk ratio,那你用計算器只能得到log odds ratio,這個數值並不是effect size。有沒有簡單轉換公式可以用呢?
那我們一步一步來。
首先,可以到 http://www.campbellcollaboration.org/escalc/html/EffectSizeCalculator-OR4.php,開始使用計算器。
Effect Size Calculator 1
把相關資料輸入之後,會看到下面OR logged = 2.3163,這是我們要用來計算的。
那怎麼把log odds ratio轉換呢?
Introduction to Meta-Analysis 這本書的方法是把log odds ration 乘以根號3,再除以Pi (3.1416)。
拿上面的例子來算,就是2.3163 * sqrt(3) / 3.1416, 算出來是1.2770。
另外一種快速算法,是從http://www.aliquote.org/pub/odds_meta.pdf 文章建議的,直接除以1.81,結果是1.2797。
這兩種算法都可以,結果也相似,就供大家參考囉!
參考文章
A simple method for converting an odds ratio to effect size for use in meta-analysis
Introduction to Meta-Analysis (相關章節pdf檔下載)…

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合併多csv或excel檔案為一個sheet

有時候要作統計分析前,有很多準備工作得作。如何把資料放到stata或其它統計軟體,就是一門學問。

最理想的狀況是:你只有一個excel或csv檔,你就可以輕易地匯入統計軟體。但常常人算不如天算,有時候你的資料是同樣格式,但你有幾十個甚至幾百個檔案。如果你直接匯入stata,那你每一個檔案得:1) 先匯入 2) 存成stata 格式 3) 清空資料,再匯入下一筆 4) 最後合併。

這太麻煩了。所以想辦法在excel或csv的時候,把多個檔案合併成一個,會省你很多時間。

上網半天,找了個還算省事的方法,步驟先說明如下:

1) 用軟體,將數個csv或excel檔,合併到一個spreadsheet裡。

2) 有必要時,重複上一步驟,最終還是得到一個檔。

3) 清理一下這個檔的表頭 (如果第一行是title而不是資料數值)。

4) 匯入 stata。

最關鍵的就是:如何合併?

上網半天,找到一個人家寫好的程式:http://jeeshenlee.wordpress.com/2010/09/23/jmc-excel-join-merge-combine-multiple-excel-sheets-or-excel-workbooks/

直接下載:JMC Excel (Trial version, Version 2) here

試用版一次只能匯入十個檔。如果你有幾十個,就分幾次合併成一個檔。

軟體操作還滿容易的,如果有大量匯入需求,也可以考慮購買。

jmc excel merge

如果你有更簡便的方法,或是你自行開發了excel 的macro,請麻煩告訴我喔!…

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讀書心得:Evernote超效率數位筆記術

翻閱一下自己使用Evernote的紀錄,原來Evernote已經從各方面滲入我的生活近三年了。還記得在2009年左右,是我修課並大量閱讀學術文章的時候,雖然我習慣用OneNote來整理論文 (見前文:利用OneNote組織論文) ,但是有許多小的片斷,或是看書的一些想法,一直找不到好的整理方式

舉個實際例子來說,我在找期刊文章A的時候,常常會發現:期刊文章旁邊,會提供其它相似文章,還會提供最近哪篇文章引用了我正在閱讀的文章。於是,我想紀錄的,有期刊文章A中的內容、其它相似文章B、C、D,引用了期刊A文章的E、F、G。另外,有時候在看期刊某一卷、某一期的時候,會看到其它文章H、I,也是討論相同主題,但從不同角度,讓我又忍不住想看看別人怎麼某個研究問題的,點進去看,又會發現有類似文章、引用此文章的文章…等,這就陷入了一個無盡的資料大海裡…。

後來,我找到了我的第二顆大腦:Evernote。

以往我作這些事情的時候,常常看了A,下載了B、C、D,忘了搜尋E、F、G,弄了一圈回來,忘了自己A這篇文章還沒看。而現在我的第二顆大腦EverNote,現在就幫著我記憶,讓我知道我現在正在作什麼,接下來要作什麼

經過近三年的使用,我以為我已經非常善用Evernote,這次閱讀《Evernote超效率數位筆記術》,才發現自己遠遠沒有入門。可笑的是:當初在電腦玩物的網站上看到介紹,我心裡還想著:記筆記不就那麼回事?我都用了快三年了,難道還能從這本書上學到什麼?如果你也有此觀念,不妨先看看下方的目錄與我的介紹,相信你也會和我一樣,有很大的啟發的。

《Evernote超效率數位筆記術》是電腦玩物站長esor與四位喜歡Evernote的好友共同編輯的Evernote活用故事,esor在他的網站上發表過多篇Evernote文章,我也都拜讀過,但這本書給我的啟發更多。

evernote-cover-200

內容大綱:http://goo.gl/VbzVn

大綱

《Evernote超效率數位筆記術》這本書我很喜歡esor他們的分類,將每一章說成是一本筆記本,所以這本書一共有:

1號筆記本:你需要一顆數位大腦

2號筆記本:筆記記住任何事

3號筆記本:讓記憶變得更有效率

4號筆記本:結合時間管理的筆記本

5號筆記本:你的工作最佳化

6號筆記本:你的學習最佳化

7號筆記本:你的生活最佳化

我喜歡的地方

這本書有幾個地方我非常喜歡:

1.…

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